پیش‌بینی شبکه تنظیمی مرتبط با کبد مرغ های تخم‌گذار در دوره تخم‌گذاری با استفاده از داده‌های RNA-seq و miRNA-seq

کد مقاله : 1135-NSAP6TH (R1)

نویسندگان

سارا فتحی * دانشگاه تربیت مدرس

چکیده مقاله

عملکرد تخم‌گذاری یک ویژگی مهم اقتصادی در مرغ‌های تخم‌گذار می‌باشد که بسیار تحت تاثیر فعالیت کبد قرار دارد. در تحقیق حاضر با استفاده از داده‌های RNA-seq ، miRNA-seq و فاکتورهای رونویسی به صورت تلفیقی، شبکه تنظیمی ژن‌های درگیر در کبد مرغ‌های تخم‌گذار در دوره تخمگذاری با استفاده از روش مبتنی بر بیان بررسی شد. به طور کلی 362 خوشه (شبکه) توسط نرم‌افزار لمون‌تری ترسیم گردید. از این تعداد 134 خوشه دارای تنظیم‌گر هستند. تعداد خوشه‌های دارای miRNA 91 و خوشه‌های دارای فاکتور رونویسی 107 عدد و خوشه‌های حاوی هر دو تنظیم‌گر 64 عدد می باشند. 27 خوشه فقط دارای miRNA و 41 خوشه تنها توسط فاکتور رونویسی تنظیم می‌گردد. در تحقیق حاضر ژن‌ها و تنظیم‌گر‌ها مورد بررسی قرار گرفتند. بر اساس مطالعاتی که قبلا درباره‌ی این ژن‌ها انجام شده بود، بیشتر ژ‌ن‌ها و تنظیم‌گرهای این خوشه‌ها در مسیر متابولیسم لیپید و کبد (به طور مستقیم و غیر مسقیم) نقش داشتند.

کلیدواژه ها

کبد،دوره تخمگذاری،شبکه تنظیمی، RNA-seq

وضعیت: پذیرفته شده برای ارسال فایل های ارائه پوستر